شجره

۱

۷۴

Iran_11_INC

CWB117-77-9-7//Antares/Ky63-1294/3/
CWB117-77-9-7//Hml-02/ArabiAbiad*2

۲

۵۰

Iran_11_INC

Zarjau/80-5151//Skorohod/3/Yesevi-93

۳

۷۲

Iran_11_INC

Sadik-06/3/YEA1819/YEA195-4//Grivita

۴

۱۱

IBYT11_INC

(Lignee527/Aths//Lignee527/NK1272/3/Alanda/
CI16155//Alanda-01/Hamra)*2

۵

۶۱

Iran_11_INC

Zarjau/80-5151//Skorohod/5/Zarjau/4/Rhn-05/3/Apm/HC1905//Robur

همان­گونه که در درخت فیلوژنی ژن HKT1 مشاهده می­گردد تفاوت زیر گروه­ ها در گروه اصلی اول بیش از تفاوت آن­ها در گروه اصلی دوم بوده است. همچنین فاصله ژنتیکی بین گروه ­های اصلی اول تا چهارم زیاد نبوده اما در گروه ­های بعدی اختلاف بین گروه ­های اصلی به استثنای گروه اصلی دهم سیر صعودی داشته است. زیرگروه­های گروه اصلی اول را می­توان به دو بخش کلی تقسیم نمود. در بخش ابتدائی این شاخه اصلی، اختلاف ژنتیکی بین زیر گروه­ ها بسیار اندک و در بسیاری از موارد صفر می­باشد و این بدین دلیل است که بیش از ۹۹% از ژنوتیپ­های این بخش متعلق به ایران می­باشند. اما ژنوتیپ­های موجود در بخش دوم زیرگروه­های این شاخه اصلی دارای اختلاف ژنتیکی نسبتاً متوسطی با یکدیگر هستند زیرا آن­ها مخلوطی از ژنوتیپ­های ایرانی و خارجی با منشأ مختلف می­باشند. در شاخه اصلی دوم، زیر گروه ­های متشکل از ژنوتیپ­های جدیدی که به شاخه اصلی قبلی ملحق شدند دارای اختلاف ژنتیکی بسیار اندکی با یکدیگر می­باشند زیرا آن­ها نیز دارای منشأ ایرانی هستند. به استثنای سه ژنوتیپ خارجی که اختلاف آن­ها با سایر ژنوتیپ­ها در شکل ۲-۳ نیز قابل مشاهده است. شاخه اصلی هفتم نیز دارای زیر گروه­هایی است که اختلاف ژنتیکی آن­ها قابل ملاحظه است و این به دلیل تفاوت منشأ ژنتیکی ژنوتیپ­هایی است که در این زیر گروه قرار گرفته­اند. در انتهای درخت فیلوژنی ۵ شاخه اصلی دیگر قرار دارد که هر یک با اضافه شدن یک ژنوتیپ جدید ایجاد شده ­اند. در شاخه­ های اصلی هشتم، نهم، دهم و دوازدهم ژنوتیپ­های ایرانی قرار گرفته­اند اما منشأ ژنتیکی آن­ها با یکدیگر تفاوت زیادی دارد و این امر موجب ایجاد اختلاف ژنتیکی زیاد بین این شاخه­ های اصلی گردیده است. این درخت فیلوژنی دقیقاً رابطه ژنتیکی بین ارقام را براساس منشأ و فاصله ژنتیکی آن­ها تشریح می­نماید. برای مثال اکثر ارقام ایرانی در دو گروه اول و دوم طبقه بندی شده و زیرگروه­هایی را تشکیل داده­اند که فاصله ژنتیکی بین آن­ها بسیار کم بوده است. اما ژنوتیپ­های موجود در شاخه­ های انتهائی درخت فیلوژنی، علی رغم اینکه متعلق به ایران بوده و در ایران کشت می­گردند، به دلیل دارا بودن منشأ ژنتیکی بسیار متفاوت با سایر ژنوتیپ­های ایرانی اختلاف و فاصله ژنتیکی زیادی با آن­ها نشان داده و در گروه ­های اصلی و مستقلی طبقه ­بندی شدند.

( اینجا فقط تکه ای از متن فایل پایان نامه درج شده است. برای خرید متن کامل پایان نامه با فرمت ورد می توانید به سایت feko.ir مراجعه نمایید و کلمه کلیدی مورد نظرتان را جستجو نمایید. )

۳-۶ درخت فیلوژنتیکی ژن CBL4
توالی نوکلئوتیدی قطعه کامل ژنی ژن CBL4 در ۹۶ ژنوتیپ با توالی ژنی مربوط در رقم شاهد (رقم کلیپر جو) مقایسه شده و به هفت کانتیگ تقسیم بندی گردید. به دلیل وجود تعداد زیاد کانتیگ­ها و نرخ بالای موتاسیون در هر کانتیگ، درخت فیلوژنتیکی ژن CBL4 برای هر کانتیگ به صورت مجزا ترسیم گردید. این درخت­های فیلوژنی در شکل­های ۳- ۴ تا ۳- ۹ نشان داده شده­ اند.
شکل ۳-۴ درخت فیلوژنی ژن CBL4 در کانتیگ اول
مشخصات ژنوتیپ­های درخت فیلوژنی ژن CBL4 در کانتیگ اول در جدول ۳- ۸ ارائه شده است.
جدول ۳-۸ مشخصات ژنوتیپهای درخت فیلوژنی ژن CBL4 در کانتیگ اول

ردیف

شماره ژنوتیپ

منشأ

شجره